Файлы и биты

Вопрос по программированию от неспециалиста. Вот я хочу прочитать файл в С и проинтерпретировать его весь как запись большого двоичного числа. Какие подводные камни могут быть?

Например, я открываю файл в N байт, и считываю его побайтово как символьный массив типа char длины N. Потом смотрю битовое представление каждого символа, и формирую массив из нулей и единичек длины 8*N. С которым я потом работаю, как с большим двоичным числом в 8*N разрядов. Результат алгоритма у меня условно говоря двоичное чиcло размерности 8*M. Я его делю на блоки по 8 бит, формирую обратно новый символьный массив в М байт. И записываю это все дело в файл.

Что может пойти не так?